光学显微镜是地层古生物学科的常规设备，依托单位项目涉及的生物门类鉴定工作，多依赖于光学显微镜的显微观察与数字成像。所级中心配置的设备特点，以特殊功能为主体，结合科研人员自用光学显微镜，形成光学显微观察的体系化支撑服务，满足科研项目的各项功能需求。
在提供化石修理的免费支撑服务的基础上，该平台提供各类型特殊功能设备，纳入免费共享使用管理。主体设备包括：同轴体式显微镜（Axio Zoom V16）、荧光光学显微镜（Zeiss V12）、阴极发光显微镜（CL8200MK 5-2)、全自动玻片扫描系统（Axio Scan Z1）、超景深三维立体显微成像系统（VHX-6000），共计6台套，设备总值464.738万元。
